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新的测序方法分析肺部微生物组以预测儿童骨髓移植后的死亡率

对于接受骨髓移植的儿童来说,即使是轻微的呼吸道感染也可能致命。现在,加州大学旧金山分校 (UF) 和陈扎克伯格旧金山生物中心 (CZ Biohub SF) 的科学家以及一个国际研究小组发现了某些微生物群落与这些患者的相对死亡风险之间的联系。

他们使用了一种先进的方法,可以快速全面地识别肺部中存在的所有潜在致病生物。这项新研究于 2024 年 5 月 23 日发表在《自然医学》杂志上,为更精确的诊断和最终的治疗指明了方向,以提高儿童移植后的存活率。

该研究团队包括来自美国、加拿大和澳大利亚医院的数十名研究人员,他们招募了一大批儿科患者,并使用一种称为宏基因组下一代测序 (mNGS) 的技术来分析从肺部收集的液体。

在确定了每个样本中各种微生物的相对丰度后,研究人员将患者分为四个不同的“群体”,以便预测哪些儿童最容易受到致命的肺损伤。他们发现,与其他群体相比,结果最差的儿童总体上微生物种类明显较少,但葡萄球菌和病毒数量明显较多。

“我们从 32 家医院的 229 名儿童骨髓移植患者身上采集了样本,”第一作者、加州大学旧金山分校儿科助理教授 Matt Zinter 说道。“我们的研究结果在一个完全独立的队列中得到了验证,结果表明,肺微环境可以预测或预后死亡风险。我们的最终目标是找出如何调节肺部生物学,以造福患者。”

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