生物学家使用基因组数据库研究癌细胞

佛罗里达州立大学生物科学教授大卫吉尔伯特正在使用有关人类基因组的最新信息作为更好地了解癌症的指南。

Gilbert 和他的 FSU 同事是一个团队的成员，该团队使用他开发的一种新方法将不同的癌细胞类型与正常人体细胞数据库进行比较，该方法可以识别癌症起源的细胞类型。通过将各种癌细胞与正常细胞的集合进行比较，他们能够分辨出哪些癌症与不同的细胞类型最匹配。

“癌细胞来自你体内的一个细胞，但它们已经发生了变化，”吉尔伯特说。“在评估复发患者的新肿瘤是源自原始肿瘤还是完全是一种新癌症时，了解它们来自哪种细胞类型尤为重要。”

他们的工作发表在Nature Communications上，是一系列出版物的姊妹篇，该系列出版物是国际上为了解人类基因组如何工作而做出的努力，由美国国立卫生研究院资助，称为 DNA 元素百科全书 (ENCODE)。因为只有 1% 的人类 DNA 编码任何已知的蛋白质，所以了解我们基因组其余部分的功能一直是一个巨大的挑战。

Gilbert 和他的同事也是更大的 ENCODE 出版物的贡献者，该出版物发表在 Nature 上，总结了最新一轮 ENCODE 资助的努力。这项研究的亮点是绘制了人类基因组中近一百万个元素的图谱，覆盖了基因组的 8%，这些元素调节基因。也就是说，它们决定了一个基因的表达量和在什么身体组织中的表达。

“生物体的复杂性不在于它拥有的蛋白质编码基因的数量，”吉尔伯特说。“它存在于这些基因的组合中。我们拥有与蠕虫和苍蝇几乎相同数量的基因，但我们以更复杂的组合表达它们。”

他的实验室将复制——DNA 复制自身的过程——添加到图片中。